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呼吸科是全國最早的肺部感染方面國家繼續教育培訓基地，具有雄厚的臨床和科研實力。擁有較大規模的微生物實驗室，承擔了全院的臨床微生物檢查工作，負責呼吸機相關肺炎的臨床處理、預防控制等指導文件的制訂。曾多次參與中華醫學會呼吸分會制定社區獲得性和院內獲得性肺炎診治指南、呼吸機相關肺炎臨床處理和預防控制的初步建議等制定。