陳軍三十多年來一直在國家三甲醫院江蘇省級臨床重點專科和連云港市Ⅰ類重點學科醫療衛生第一線工作，江蘇省卒中學會神經外科專業委員會常委、江蘇省醫學會神經外科分會神經腫瘤學組成員、江蘇省抗癌協會神經腫瘤委員會委員、江蘇省腦膠質瘤協作組委員、江蘇省“333”學科帶頭人培養對象、連云港市神經外科學會副主任委員、連云港市醫學重點領軍型人才、徐州醫學院碩士生導師、南京醫科大學教授、北京大學中文核心期刊《中國微創外科雜志》、《臨床神經外科雜志》編委。 承擔本市及周邊地區神經外科疑難危重病人的會診搶救工作，經驗豐富，開展了顯微神經外科手術夾閉腦動脈瘤、巨大聽神經瘤保留面神經手術、顯微血管減壓治療三叉神經痛和面肌痙攣、經口咽入路齒狀突畸形磨除術、以及神經導航、微創技術治愈各種腦腫瘤、脊髓腫瘤，腦外傷、脊髓外傷，高血壓腦出血萬余例，能熟練進行了全腦血管、全脊髓血管造影，能獨立掌握各種動脈瘤手術入路及操作技巧，發表四十余篇論文在國家級、省級核心期刊。 2005年赴韓國漢城國立大學醫院進修神經外科，分別在上海醫科大學附屬華山醫院全國神經外科進修班學習顯微神經外科；在首都醫科大學附屬天壇醫院全國神經外科高級進修班學習神經外科疾病的微創治療；具有較扎實的神經外科理論和實踐基礎；在南京大學醫學院碩士研究生班學習中，系統地學習了神經外科的科研方法和技術。 積極引進新技術引進的臨床工作，排名第一獲得三項江蘇省醫學新技術引進二等獎：“超選擇動脈插管溶栓及血管成型術治療急性腦梗塞”、“選擇性動脈灌注治療腦血管痙攣”、“動脈溶栓及血管成型支架術治療危重椎基底動脈血栓”。完成科研課題并獲得連云港市科技進步獎十三項：“重型顱腦損傷患者的顱內壓監護”、“ 急性顱腦損傷患者心鈉素含量研究”、“ 急性顱腦損傷患者內皮素含量研究”、“ 腦脊液腰穿置換治療顱內感染”、“ 高血壓基底節出血術后顱外并發癥”、“超選擇動脈插管溶栓及血管成型術治療急性腦梗塞的臨床研究”、“術中動脈瘤破裂的預防和處理”、“超選擇動脈內灌注及血管成型術治療腦血管痙攣的臨床研究”、“破裂腦動脈瘤早期診斷和治療的系列臨床研究” 、“腦動脈瘤手術中載瘤動脈阻斷與灌注成型研究”、“ 斜坡中央凹陷區顯微外科解剖及手術入路的數量化研究”、“高血壓腦出血的規范化外科治療”、“煙霧病腦血運重建術的規范化研究（重大疾病診治關鍵技術應用）”。

應用神經導航、內鏡及顯微鏡精確微創手術治療腦膜瘤,腦膠質瘤,聽神經瘤,垂體瘤等各種腦腫瘤,脊膜瘤,神經纖維瘤等各種椎管內腫瘤及小腦扁桃體下疝脊髓空洞癥,面肌痙攣，三叉神經痛等神經功能疾病,規范化手術治療腦外傷、腦積水、脊椎外傷、高血壓腦出血、顱內動脈瘤等。